和民政相比，軍政無疑占去了周士相大半精力，為了強化各鎮戰斗力，他在各鎮之間來回視察，衛尉以上軍官幾乎都接見了一遍，兵備講習所也去了幾趟，甚至在第一鎮親自為士卒示范前世所學步兵剌殺術。↑，.
因條件有限，周士相無法為火銃兵配備剌刀，因此火銃兵都是另佩腰刀，腰刀數量不夠的便配匕首和短劍，以免在霧雨天氣作戰時，火銃變成如神灣之戰時的燒火棍。
剌殺戰術的教練主要集中在長矛手這一塊，長矛統一制式三米五，以白蠟桿制成。作戰時，若雙人組刺殺則一人刺腿一人刺頭；三人組刺殺一人刺頭、一人刺腿、一人格擋。訓練和作戰時都以簡單靈活為前提。
為最大程度發揮火器優勢，各鎮所轄三旅中的丙旅為全火器作戰部隊，甲旅和乙旅以刀盾手和長矛手為主。
周士相制定的作戰手則中明確規定與清軍交戰時，甲、乙二旅必列丙旅兩翼，前突三十米左右，以掩護丙旅火銃隊列不被清軍沖散。火銃旅列隊作戰時，同樣要分置兩翼形成交叉火力。戰況激烈，火銃射速無法壓制當面敵軍時，火銃手則棄火槍拔刀作戰。
如集團作戰，則騎兵旅承擔側翼掩護，炮營置于大陣后方，視其必要前突作戰。步炮協同這個戰術周士相還沒法在軍中推廣，主要是炮營這一塊火炮屬于落后的前裝炮。炮子多是實心彈，而能發射散彈的大桿子銃和虎蹲炮數量有限。威力和射程也有限，根本不可能搞什么步炮協同。真要這樣做了，被自家炮火轟死的肯定要比清軍多。
在香山第四鎮視察時，周士相向廣州傳回一道命令，要宋襄公組織鐵匠打造鐵鍬，哪怕因此耽擱生產農具。也務必在一個月內打造5000把鐵鍬出來。其實周士相想要的是工兵鏟。可是現下技術達不到，生產規模也達不到，只能將就用這個時代農民常用的長柄鐵鍬。
在香山時，周士相又要人建了一座“碉堡”，此堡以磚石混和煮成糊狀的糯米制作而成。高三米，堡內可屯一伍兵，自上而下分別開了十二個孔洞，每個孔洞都可以擺放火銃進行射擊，也可射箭。堡頂還建有遮擋木板，當中置有一口鐵鍋，如此既可熬金汁燙殺靠近碉堡的敵兵，也可在上面點“狼煙”向后方通傳軍情。
香山縣找來的幾十個泥瓦匠干了三天才把一座碉堡按周士相的意思建造完畢。周士相對他們的速度很不滿意。將修建過程程序化，每道程序都精簡固定后，要泥瓦匠們再造，結果這一次只花了兩天，可周士相還是不滿意，最終，泥瓦匠們共了半天時間將周大帥所需的碉堡給建了起來。
碉堡樣式簡單。內中生活設施幾乎沒有，除了能殺人外，基本上就沒有什么用處。里面空間狹小，短期呆上幾天還行，時間一長人根本受不了。周士相自己進去呆了呆，就覺氣悶。這氣悶不是因為呼吸困難，而是那種隱性的受憋。
給了這幫泥瓦匠賞賜后，周士相又讓他們在碉堡的基礎上再建“崗樓”。這崗樓實際就是擴大版的碉堡，高近五米多，體積也是碉堡的三倍，除和碉堡一樣有軍事設置外，崗樓后面還有生活居，可住人，可煮飯，也可養馬。生活區修有兩人多高的圍墻，寬一米多，上面可走人，有簡易防御工事。
如此一座崗樓，即便泥瓦匠們為了賞金賣命的干，最終也花了三天時間方建好。
周士相皺著眉頭認可了這個速度，接下去便是將這幫泥瓦匠全部征入軍中，另外讓廣州將各縣泥瓦匠全部集中到廣州，再招募數千青壯入營學習。所學不是如何殺敵，也不是其他，而是怎么造碉堡和崗樓。
半天一座碉堡，三天一座崗樓，修好有賞，修不好受罰是周士相給這幫被征募的泥瓦匠和青壯的唯一命令。
建碉堡和崗樓需要大量磚石和糯米，周士相讓宋襄公無論使什么手段都要預備可建500座碉堡和100座崗樓所需要的原料，廣州附近原有的磚窯廠全部生產，同時民部驛傳司要馬上在各地建新窯，確保磚石生產能夠跟上進度。各縣的青壯男丁要全部動員起來，男人不夠女人也要上。
不但太平軍控制的各縣被動員起來建窯產磚，周士相更派人到惠州讓胡啟立也在惠東的海豐地區建窯產磚，所產的磚石太平軍全部收購，但不運回廣州，而是囤積當地。
胡啟立雖然不知道太平軍要這么多的磚頭做什么，但為得到周士相的支援，立即命人將制窯的事情落實了下去。
正和潮州吳六奇對峙的胡啟立也收到了清廷簡親王濟度大軍南下的消息，驚恐之下他已派了兩撥人到廣州向周士相求援。周士相答應年關之后便親率太平軍主力進駐惠州，這讓胡啟立稍稍安定。
周士相原定計劃25號離開香山回廣州，可號宋襄公就派人急匆匆的過來告訴他朝廷的欽差大臣來了。
永歷朝廷來人了這么快周士相有些驚訝，他派往昆明報捷的使者眼下應該還沒到昆明，怎么永歷朝廷就那么快派人來廣州了，難道事情出了什么變故 想到這些日子自己對廣州和太平軍付出的心血，周士相不由一個激靈，他很怕永歷朝廷腦子發熱派人來接收廣州，不承認他所設的布政使司衙門，不承認他給胡啟立、胡明義、王兆興、王章鈞、左清等降官降將的任免，那樣便意味著周士相不得不和永歷朝廷翻臉，雖不致于扯反旗造永歷的反，但和廣東明軍的合作恐怕就困難了。畢竟和自己這個兩世為人的總兵相比，凌海將軍陳奇策和鎮國將軍朱統他們對朱明正統的觀念很強，若在朝廷和周士相兩者之間選一個，他們肯定不會選擇后者，而他二人手上的水師恰恰是周士相所需要借助的力量。
