吳三桂兵進永昌之時，清軍統帥、信郡王多尼也率滿漢大軍進至昆明，于城外安營扎寨。左路清軍線國安部也突破廣西府城，定于26日前來昆明會師。
抵達昆明后，多尼便感到頭疼，讓他頭疼的是入滇各部的糧草運輸出現問題。
清軍進入云南后，李定國便令各部明軍實行堅壁清野，使得清軍無法在云南就地補充糧草，加上明軍突然退去，清軍在沒有抵抗的情況下長驅直入，結果固然占領了云南大部地區，可在錢糧方面卻是所獲有限，后勤補給線也隨著清軍推進過快出現問題，設在貴陽的糧草大營已經不能按照原先的計劃定期向各部清軍轉運糧草。
另外，明軍主力部隊雖退去，可云南及貴州境內仍有不少明軍雜牌和土司武裝反抗清軍，他們的存在直接威脅到了清軍糧道，已致多尼不得不令平郡王羅可驛帶兵北返，以確保糧道安全。
昆明這場大火讓多尼也是措手不及，大火不僅焚毀了李定國屯于城中的數百萬石糧食，更讓城中百姓的存糧也毀于一旦，使得清軍想從百姓手中搜糧都不得。
倘若永歷朝廷隨著昆明城一起覆沒，那么清軍的糧草問題也不算多大，可現在永歷朝廷跑到了滇西，李定國、白文選等明軍主力也退到了滇西南一帶阻擊清軍。永歷朝廷一日不亡，這場戰爭便一日不能結束。而戰爭一日不能結束，大軍所需錢糧就是個無底洞，單靠貴陽糧草輸送，顯然是無法支撐入滇清軍長時間和明軍對峙的。
一方面，多尼將速戰速決的希望放在了兵進永昌的吳三桂身上；另一方面，他讓洪承疇帶著固山額真宜爾德、戶部章京卓羅、提督張勇到已占領各府州縣視察，期望能夠通過搜刮這些地方的糧食解決大軍糧草不足的問題。
結果讓多尼很失望，洪承疇回來奏報，說各府、州、縣的錢糧他已叫府廳官員詳細盤點，可就算把這些地方的錢糧全運到昆明來，也不夠大軍開支半月。現云南境內只有征南將軍趙布泰駐扎的宜良縣城略有糧米所得，其余各處都是坐吃山空，全靠貴州糧草輸送。
多尼年輕，也是第一次出任大軍統帥，缺少處置經驗，他問洪承疇有什么辦法可以緩解糧草不濟，洪承疇卻搖頭說沒有。巧婦難為無米之炊，洪承疇其實很想告訴多尼，目前這個局面其實是清軍自己造成的，要不是清軍各部在云南境內燒殺搶掠，云南百姓也不會視清兵為仇寇，那些土司也不會仍舊站在明朝那邊不肯相助大清。若一開始清軍便對云南推行剿撫并重的策略，對那些地方實力派和土司們加以拉攏，也不會落到如今舉步維艱的下場。
多尼有些失望，洪承疇明確告訴他，想要繼續支撐這場戰事，貴州的糧食便是清軍的生命線。而貴州的糧食又是清廷從東南調來的漕米，所以西南戰事一日不結束，東南漕米便一日不能調撥京師，時間久了，京師定然有怨言。
洪承疇的提醒讓多尼有些警醒，六天前皇帝派來的使者除了恭賀大將軍進展順利外，也提到了皇帝希望大將軍盡快結束西南戰事，從而可以抽出兵馬解決廣東的太平軍，另外東南方面也需回兵，情報顯示金廈的鄭氏八月出兵北上并不是攻打浙江，而是想從長江直驅南京城下。雖說鄭氏船隊于洋山海面遭遇颶風損失慘重，但鄭氏父子經營數十年，富可敵國，這場颶風造成的損失并未動搖鄭氏根本，因此鄭氏很可能會繼續北上攻打南京。所以為防萬一，皇帝希望大將軍可以早點結束西南戰事。
多尼何嘗不想快點班師回京，可永歷朝廷還沒覆沒，他想班師也不得。現在唯一的希望就是吳三桂不負重望，能把朱由榔擒殺在永昌了。
苦悶時，貴陽卻傳來八百里急報。
急報是廣西巡撫陳維新通過貴陽的軍驛發來的，他言告廣東太平軍已入廣西，梧州、潯州、柳州等重鎮皆被太平軍占領。鑒于太平軍兵馬強大，桂林孤城難守，陳維新為保存官兵實力，便率部退入貴州都勻。信中，陳維新稱入桂的太平軍兵力有十數萬之眾，不僅有水師，還有騎兵，寇首周士相麾下更有一支鐵甲兵，遇人斬人，遇馬斬馬，頗是悍勇。
陳維新其實一開始并不是想退入貴州，而是想從南丹直接退入云南和線國安會合的，可攻占了桂林的太平軍第五鎮一直緊咬他不放，若是按原計劃退入云南和線國安會合，陳維新擔心自己可能撐不下去，所以在總兵徐天佑等人的勸說下，他領著殘部退到了貴州境內。追擊的太平軍發現陳維新退入貴州境內后，不知為何竟沒有再追下去。陳維新對此的判斷是太平軍的目的就是入云南勤王，所以他們不愿意進入貴州耽擱時間。
“廣東蠻子進展也太快了些吧？”
多尼年輕的臉龐上浮現一絲訝色，有濟度的前車之鑒在，他自然不懷疑廣東那支明軍的戰斗力，也不會輕視，但是對方的推進速度仍然超出了他的想象。
半個月前多尼接到趙布泰的奏報說太平軍已經進入廣西并占領梧州，巡撫陳維新派人八百里急報請求線國安領兵回援，但趙布泰卻認為廣西不比云南，太平軍攻打廣西的目的就是為了到云南救他們的朝廷，所以誰主誰次顯然很清楚。大清軍的用兵方向只能是云南的永歷朝廷，廣西那邊雖梧州已失，但尚有柳州、潯州、桂林、南寧等大城橫在太平軍入滇路上，可令這些地方的守軍堅守以遲滯太平軍的腳步，這樣等到他們拿下廣西，打通和云南的通道時，云南這邊的大局早已定了。沒有了朝廷，沒有了大義，太平軍再是能打也終將分崩離析。
多尼采納了趙布泰的建議，他和洪承疇商量的結果是太平軍進展再快，也須至少三個月時間方能占領廣西，可現在，太平軍只用了一個月的時間就占領了廣西數座重鎮，速度之快，多尼感到很是心驚。(
